慶長5年（1600）ときは関ケ原の戦いの時、延岡藩宮崎城でも西と東に分かれての戦いがあった。
　そのとき、城代であった権藤平左衛門種盛の末子がなんとか落ち延び流浪の末僧永傳として延岡の藩主有馬直純に見出された。
　正保2年（1645）宮崎城跡近くのこの土地に永傳の子、門解が一寺を設立、有馬直純の徳をしのんで直純寺と名づけた。
　350年をも超える宮崎の歴史の中では非常に大きな位置を占める浄土真宗の直純寺。
　その静かな境内の一角に設けられた保育園なので、由緒ある名前をいただき、昭和38年に直純寺こども園の前身である、直純寺保育園と名づけられた。